空から襲う巨大な悪魔と平和を守る魔女の戦場となり、滅亡の危機に陥る伊都夏市。

ある日主人公は、何故か記憶喪失で大空から落下していることに気づく。いきなり絶対絶命のピンチの中で、焦る主人公。そんな彼の前に突然、彗に跨っ て空を飛ぶ3人の少女たちが現れた。主人公を尻目に空中で不可視の巨大怪獣と命懸けの戦いを始める少女たち。いきなりの非現実的な状況に混乱する主人公だったが、落下している現実は覆ることなく、地面に激突して死んでしまう。

──再び意識を取り戻すと、そこは天国、神の国だった。永遠と広がる何もない空間の中、目の前の巨大なテレビに映し出された、幼女がこう告げる。
「わたちは神様でち。生き返りたいでちか？」

果たして彼は、彼女たちの、そしてセカイの運命を変えることができるのか？